De meest gevaren routes zijn de West Route en de Noord Route, beiden door het typische Hollandse landschap. Door de bouw en de beperkte afmetingen van het schip kan de Maria Alberta ook de kleinere waterwegen bevaren.

De West Route gaat vanuit Amsterdam langs Gouda, Rotterdam, Delft, Den Haag, Leiden, Haarlem en eindigt weer in Amsterdam.

De Noord Route voert vanuit Amsterdam langs Purmerend, Broek op Langedijk, Den Helder, Alkmaar en eindigt weer in Amsterdam, waarbij men één dag in Den Helder blijft zodat de gasten eventueel Texel kunnen bezoeken. De duur van de routes is gewoonlijk van zaterdagmiddag tot en met zaterdagochtend, waarbij op zaterdag niet wordt gevaren.